世家子弟，悍然发动兵变，据城自守，有勾结地方豪强、绿林，意图武装对抗。
然而，在得到皇帝明确授权镇压的汉军主力，特别是神甲军面前，这些零星抵抗如同螳臂当车，被迅速镇压下去，主事者皆被明正典刑，悬首示众，以儆效尤。
与此同时，朝廷之上奏折堆积如山。
无数官员的妻族、母族、姻亲故旧被卷入案中，求情的、辩白的、喊冤的、以辞官相威胁的奏疏飞向御案。
在野的文人士子受某些势力鼓动或出于自身理念，开始大肆撰文，引用经典，抨击朝廷“操切”、“暴虐”、“动摇国本”，营造不利于清洗的舆论。
世家大族不愿坐以待毙，纷纷断尾求生，牺牲边缘成员，旁系子弟或无关紧要的附属势力，抛出替罪羔羊，切割与核心罪案的关联，保住家族核心血脉与主要资源。
同时，开始转移隐匿土地、金银、古籍等财富，或化整为零转入偏远宗支，或假借捐赠之名藏于寺庙、道观，或通过复杂商帮运作洗白，力图避免被皇权抄没一空。
更有甚者，利用对地方粮食流通的长期垄断，故意囤积居奇，制造粮荒恐慌，企图以民生要挟朝廷，迫使皇帝让步。
齐霄的许多政令，在地方遭遇抵抗，已是石沉大海，执行艰难。