第一步，是外部标识的变更。
陈瑜提出，为了与原先被第九使徒寄生过的状态进行明确区分，也为了契合新装备系统的视觉识别，建议更改三号机的涂装方案。
这一提议得到了批准。
于是，在格纳库内，三号机原本以深色为主的装甲被逐一拆卸、处理，重新喷涂。
新的涂装以白色作为主色调，取代了原先的深色，并在肩部、胸甲以及腿部关键区域，添加了鲜明而富有科技感的红色条纹。
当涂装完成，整台机体焕然一新，白色的主体显得冷峻而肃穆，跳跃的红色条纹则暗示著其内蕴含的强大力量与攻击性。
这台新的三号机，在外观上已与过去截然不同，视觉上更具辨识度，也清晰地宣告了其进入了一个由陈瑜主导的新阶段。
当然，改造远不止于涂装。
陈瑜系统地推进了他的「基路伯」全系统集成。
肩部加装了标准接口的多功能榴弹发射器模块，手臂与腿部装甲内部预留了用于搭载「基路伯—I型」手雷的快速释放装置。
背部接口经过重新设计，以更高效地连接并供能给那台小型化的阳电子炮。
机体内部的火控系统与数据链也进行了全面升级，以兼容装备的「基路伯I型」特种弹头的瞄准与发射需求。
除此之外，陈瑜还以「提升操控效率与驾驶员安全保障」为由，对三号机的部分内部系统进行了「优化」。
这其中，自然包括他对那套傀儡系统深入研究与隐蔽修改。
在官方记录中，这是对系统稳定性的增强和冗余备份的完善。
而实际上，陈瑜依据其彻底解析的底层逻辑，植入了一系列极其隐蔽的控制协议与优先级覆盖指令。
他确保了自己在必要时，拥有对该系统的最终否决权与控制权，使其从可能威胁驾驶员的枷锁，转变为一件潜在的工具。
或者说，在陈瑜真的需要的时候，三号机依旧是一具傀儡，只不过是他手中的提线傀儡。
能源系统方面，他也提出了一些「理论验证性」的调整，旨在提升三号机在脱离外部供电后的内部能源利用效率，虽然幅度有限，但确是在为未来可能需要的完全独立运作进行技术铺垫。
随著一项项改造措施的落实，白色的三号机静静地矗立在专属格纳库内，其内在已与修复之初大不相同。
它不再仅仅是一台NERV制式的EVA，而是逐渐
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