使主要在官职品级、职责地位方面存在区别：
官职品级：锦衣卫指挥使为锦衣卫的最高长官，官阶正三品。
而锦衣卫都指挥使并非锦衣卫的常规官职，其官阶为正二品，
通常是作为皇帝对自己器重的锦衣卫官员的一种嘉奖加封，属于较高的虚衔。