叛围城均告失败，所以他觉得萧衍肯定也必败无疑。外面攻着城，他还穿着金银制成的铠胄，插满羽毛、镶嵌宝石的戎服，与宫人在华光殿前演习战斗。
萧衍围城数日，王珍国退敌不成。太监茹法珍、梅虫儿劝萧宝卷说：“大臣不留意，使围不解，宜悉诛之。”王珍国等人听说这个消息，心想与其被这个昏君砍了头，不如砍了昏君的头，于是他谋应萧衍，串通宫内的宦官和侍卫，先下手为强。“是夜，帝在含德殿吹笙歌，作《女儿子》”，行人就冲入殿内，萧宝卷一看事情不妙，跳起来往北门跑，想逃往后宫，但内应已经把大门紧锁。太监黄泰平照皇帝膝盖猛砍一刀，萧宝卷仆倒，环顾四周大叫：“奴反邪!”众人齐上前，一刀割下皇帝人头。
新皇帝即位后，宣德太后下诏：“依汉海昏侯故事，追封萧宝卷东昏侯。”后来，李商隐写《齐宫词》慨叹：“永寿兵来夜不扃，金莲无复印中庭。梁台歌管三更罢，犹自风摇九子铃。”