对东林党人的怨气如此重视，是因为它关系到士心。
大明开国二百六十年，可以说积弊丛生，士农工商、各个阶层，都积蓄着不满。
这其中，士人的力量最大，影响力也是最强。朱由检治国也需要他们，需要收拢士心。
阉党对士人的残害，正好给了他机会。只要把那些残害士人的阉党给处置了，就能收拢一波士心。
历史上的崇祯皇帝之所以在亡国后被很多人同情，不得不说铲除阉党给他加了很多分。正是因为他铲除阉党，为被残害的士人昭雪，让很多的士人至死效忠，在亡国后仍旧怀念。
如今，朱由检被吴尚默的话触动，认识到自己处理阉党的力度还不够、为士人昭雪的速度也太慢。立刻把兼任起居注的翰林院官员召集起来，草拟了三条旨意：
一是把魏忠贤派出的镇守太监全部撤回，改为监督太监，只有监督职责，无权插手事务。
这件事很多臣子都提过，甚至名列阉党的王之臣，都提议撤销镇守太监。但是朱由检把太监当成自己的耳目，一直没有松口。
如今他已经认识到，太监在地方完全没有人心，留着他们只会招来怨愤。
既然把这些人当耳目，那就明确改为监督太监，不让他们插手地方事务，在地方仗着皇帝授予的权力胡作非为。
二是苏杭织造太监撤销，改为内府监织造工坊，进行市场化运作。
之前任命的织造太监王国泰，改为实任南京协同守备太监、南京内府监掌印，把织造机构改为工坊。
这个职位，也是很多臣子所抨击的。苏杭织造太监不止是负责织造，还有税务职责。万历年间的织造太监孙隆，就曾在苏州激起民变，被杀了几位随从，逃到杭州避难。
之前的织造太监李实，也被很多人参奏涉及七君子案。朱由检下令逮捕，交给大理寺审判。
但是税务还得有人负责，朱由检已经打算以撤销各地收税太监为代价，在朝廷组建专门税务机构。
三是禁止私自阉割为宦，防止出现下一个魏忠贤。
如今内廷的宦官朱由检都嫌多，不想留这么多人。所以他就投士人所好，重申《大明会典》自宫禁例，禁止私自阉割。
这三点都是对太监的限制，除此之外，还要为士人昭雪。
朱由检针对这点，又下了三条旨意：
一是褒赠恤荫死难诸臣，所有被阉党定的案子一律重审，为死难
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