这份诏书一出，可谓是重磅消息，不少臣子都是一副我不明白但是大受震撼的表情。
科道最先作出反应，以左都御史葛守礼领衔，科道御史们痛切上疏，要求朱载坖收回成命，科道言官们认为，国朝祖制，从未赋予过哪个臣子这么大的权力，即便是总督也不过最多两省之地，这次朱载坖令张居正督师南京，将整个东南托付给他，这是有违祖制的，不能给他这么大的权力，葛守礼等人要求朱载坖收回成命。
甚至一些御史跑到张居正家中去闹事，要求张居正不能接受朱载坖的诏书，大部分臣子也不能理解朱载坖这样做的意义何在。毕竟在倭寇最猖獗的时候，朝廷也不过设置浙直总督总管军务，现在倭寇已经平息，这个时候还派遣大员，出镇南京，专阃东南，这是何道理啊？
不过已经有细心的官员通过研究圣旨看出了一些端倪，张居正的职务是督师南京，节制浙直闽广等处军务事兼督理粮储，这个职务设置是很有意思，一般朝廷派遣大员总揽军务的话，应该后面是督理粮饷才对，而张居正的职务后面是督理粮储，也就是说，张居正的主要任务是催征税粮，并将之解运京师。
这样一来，朱载坖派遣张居正的目的也就昭然若揭了，不少东南出身的官员上疏表示反对，认为东南已经有总督巡抚，再派张居正督师东南实际上是无用之举，其实他们已经很清楚朝廷为什么要派张居正去南京，就是因为朱载坖对于之前的催征不满意。
朱载坖认为既然派御史或者是督粮参政去催征税粮没什么效果，那朱载坖就要派出更有分量的臣子以更加有力度的方式去催征税粮，和之前督粮御史或者督粮参政不同，他们嘴都能够差遣地方州县的官差来催征，这些州县小吏早就被士绅们喂饱了，哪里肯卖命。
而张居正可不一样，他可是持节假节钺赐天子剑的专阃大员，他去催征，调动的可是朝廷的官军去催征，现在东南官军可不是之前的卫所官军，而是真的上过战场砍过倭寇的百战雄师，再加上张居正这个方面大员，砍个把士绅连报告都不用打，被砍了你都没地方说理去。
所以东南出身的官员们竭力阻止张居正出镇，他们一方面上疏朱载坖，请求朱载坖收回成命，一方面给张居正施加压力，同时请求徐阶代为说项，但是徐阁老很清楚，朱载坖整顿东南的决
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